Das LmZ ist im Auftrag des Ministeriums für Schule und Bildung des Landes Nordrhein-Westfalen (MSB NRW) und des Ministeriums für Kinder, Jugend, Familie, Gleichstellung, Flucht und Integration des Landes Nordrhein-Westfalen (MKJFGFI NRW) tätig und gehört zur Landesstelle Schulische Integration (LaSI). Die LaSI ist organisatorisch als schulfachliches Dezernat an der Bezirksregierung Arnsberg angesiedelt. Das LmZ ist ebenso wie die LaSI landesweit tätig.